1优选植物种类
水生态修复技术有多种类型和修复方案，能够适用于多种类型的水体污染的治理。在设计修复方案时应该组合使用多种生物，这样既符合生物多样性的要求，又比较具有观赏性。例如，在徐州小沿河水源地的生态修复技术中，建造了湿生—挺水—沉水植物滨岸带。沉水植物主要选取了伊乐藻、刺苦草、龙须眼子菜、水毛茛、轮叶黑藻、狐尾藻，种植在河道两侧较低的区域;挺水植物选取了再力花、水葱、茭草和黑三棱，种植在河道两侧比沉水植物更高的一级区域;湿地植物选取了千屈菜、西伯利亚鸢尾、黄菖蒲等，种植在河道两个最高的区域。植物层次分明，既发挥了植物吸收污染物的作用，又体现了植物对环境的美化作用。
2河流形态的多样性及生物群落多样性
各种河流的生态系统并不一样，在被破坏以后想要完全地恢复到以前的状态需要投入巨额资金。在进行修复时应该尽量使其恢复原生的自然生态。河流形态具有多样性，因此在进行修复时需要保持河流的自然形态。同时，还应该使河槽与护堤在横向断面上形态保持一致。保持河流中原本的植物、石头以及岸边的植被的多样性。除了形态要有多样性，水环境也必须多样化。水环境中的动植物、微生物之间关系密切，如果这种关系被破坏，水环境净化污染物的能力也会降低。如果水生态已经被破坏，就要重新构建环境中的生物关系，首先要种植水生植物，为微生物的生长创造适宜的环境，之后再投入鱼虾等水生动物，在生态系统恢复以后，其净化水体的能力也会恢复。
3布置人工湿地
人工湿地是通过把植物、石头、小岛等人工景观组合在一起，形成优美的景观，通过水体的净化美化环境。复合人工湿地系统由垂直潜流湿地、一级和二级水平潜流湿地组成。该湿地复合系统充分考虑了植物的净化效果、观赏性、抗逆性以及耐污性，通过不同品种之间的搭配创建独特优美的复合人工湿地系统景观。在放养水生动物中，充分考虑水生动植物的营养和空间结构进行，合理设计底栖动物、滤食性浮游动物、鱼类以及虾类放养的数量和种类。通过科学、合理的动植物组合为微生物的繁衍营造一个好的环境，从而实现水质净化的目标。这不仅确保了生态效益，还具有良好的经济效益以及社会效益。
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